两者的区别在于玩法和规则不同。
飞行棋是由四种颜色组成的，上面画有飞机的图形，最多可以四个人各拿一种颜色一起玩。飞行棋里有一个骰子，玩家只要转动骰子，骰子停下来的时候正面是几，玩家就走几步。刚开始时只有投到六，玩家的飞机才能起飞，并且投到六玩家还有机会再投一次。特别说明的是，到终点时走的步数要正好到达才算胜利，不然要返回来走。
跳棋是一种可以由二至六人同时进行的棋，棋盘为六角星形，棋子分为六种颜色，每种颜色10或15枚棋子，每一位玩家使用跳棋一个角，拥有一种颜色的棋子。跳棋是一项老少皆宜、流传广泛的益智型棋类游戏。
跳棋和飞行棋的不同表现在很多方面。跳棋的胜负没有什么幸运的成分，靠的是缜密的心思。
飞行棋虽然也有策略的成分，但胜负更多被骰子的点球左右，很大程度上靠运气
飞行棋可以不飞。
一般情况下是要走的，特殊情况下可以不走。特殊包括:认输，耍赖，正常下棋，其他理由或有更重要的事要办。
就以正常下棋不走为例，如在老家没有出6无法行棋，或走在叠棋后面无法超越，又如离终点差一步，掷出2可不走，离终点差3步，掷出6可不走，差2步，掷出4可不走。
1．行棋规则
玩家可指定任一已起飞的棋子按骰子点数前进；若骰子点数符合起飞规则，也可以选择起飞一颗在基地的棋子；若骰子点数不符合起飞规则，且没有已起飞的棋子，则该玩家盖轮不行棋。
2．起飞规则
骰子点数为5和6则可控制一颗棋子从基地起飞进入停机坪。
3．回退规则
骰子点数必须恰好达到终点才算该棋子成功；如果玩家扔出的骰子点数无法刚好走到终点处，则多出来的点数，棋子将往回走。
4．跳跃规则
a、跳跃：棋子在地图形走时，如果停留在和自己颜色相同格子，可以向前一个相同颜色格子作跳跃；
b、连跳：棋子在地图形走势，如果留在和自己颜色相同的飞行起点格子，则按照图中红色箭头飞向对面的飞行终点格子，然后继续向前一个相同颜色格子作跳跃；棋子在地图形走时，如果跳跃的终点是飞行起点格子，则按照图中红色箭头飞向对面的飞行终点格子。
5．撞子规则
棋子在行进过程中走至一个格时，若已有敌方棋子停留，则可将敌方的棋子逐回基地，具体说明：
a、本方棋子路过对方妻子，不能将其撞回，必须走到位于同一格上时，才能将其撞回；
b、飞行途中经过对方棋子，可以撞回；
c、跳跃途中经过对方棋子，不能撞回；
d、叠子后，叠子参与撞与被撞时，规则相同，即叠子参与撞子时，视为一颗棋子。
6．叠子规则
棋子在行进过程中走至一格时。若已有己方棋子停留，则叠在一起，共同行动，视为一颗棋子。
7．奖励规则
骰子点数为6，则奖励多只一次骰子，最多3次。获得奖励时，先行棋，然后再掷骰子。
8．先后手规则
开始游戏时，系统随机选择一位玩家作为红色的先手（最先掷骰行棋），其余玩家的行动顺序从先手玩家开始按位置的顺时针顺序依次进行。
9．游戏结束规则
当某一玩家的四枚棋子全部飞到目的地时本局游戏结束。